El 23 de novembre de 1976 s'inaugurava amb el nom de San Ildefonso la primera estació de metro de Cornellà de Llobregat, com a terminal de la prolongació de la llavors línia V des de Pubilla Casas (avui Pubilla Cases).
L'arribada del metro a la ciutat de Cornellà de Llobregat va significar tota una fita en el seu temps i la inauguració de l'estació de Sant Ildefons va comptar amb la presència de nombroses autoritats, com el ministre d'Obres Públiques, Leopoldo Calvo-Sotelo, que després arribaria a ser president del govern espanyol, el governador civil de la província, Salvador Sánchez-Terán, i l'alcalde de Barcelona, Joaquín Viola, en qualitat de president de la Corporació Metropolitana, entre altres autoritats.
El nou tram inaugurat tenia una longitud de 2.600 metres i permetia comunicar directament tres municipis: Cornellà, l'Hospitalet i Barcelona. La prolongació incloïa, a més de l'estació de Pubilla Cases ubicada a l'Hospitalet de Llobregat, la posada en servei de tres noves estacions més, Maladeta (avui Can Vidalet), Parque Buxeres (després anomenada Boixeras i avui Can Boixeres) i Sant Ildefons, aquesta ja en el terme de Cornellà i en el mateix barri que dóna nom a l'estació.
L'ampliació va suposar també la creació de les cotxeres de Can Boixeres el mateix dia.
Sant Ildefons catalanitzaria el seu nom l'any 1982, amb la reorganització dels números de línies i canvis en els noms d’estacions, i al mateix temps que la línia V deixava la nomenclatura romana per adoptar la numeració aràbiga i passar a denominar-se línia 5.
Un any més tard, el 23 de desembre de 1983, aquesta estació deixaria de ser una estació terminal, un cop es va fer la prolongació de la línia 5 fins a Cornellà (actual Cornellà Centre), amb una altra estació al mig, Gavarra. Abans d'això, queda com a anècdota l’accident que va patir un tren de la sèrie 1000 que anava sense passatge al topar contra el cul-de-sac de l'estació de Sant Ildefons el 16 de setembre de 1978, que afortunadament es va saldar sense més conseqüències que un ferit d'escassa importància, el mateix conductor i únic ocupant del comboi.
L'any 2012 Sant Ildefons va ser objecte d’una renovació integral consistent en la renovació dels vestíbuls per aprofitar millor l'espai, la substitució de paviments, graons i revestiments de les parets, la millora de la il·luminació, de la senyalització informativa i del mobiliari, i també s'hi van instal·lar nous peatges.
Estació de Sant Ildefons actualment / Foto: Arxiu TMB